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医学公共数据库
资源来源 数据库名称 数据库网址 数据库介绍
国内资源 中国国家生物信息中心 (CNCB数据库) https://www.cncb.ac.cn/ 中国国家生物信息中心,是生物研究的重要资源平台。
国内资源 华佗遗传变异数据库网站 https://bis.zju.edu.cn/huatuo 华佗遗传变异数据库提供了人类细胞类型特异性基因调控遗传变异的全局视图。
国内资源 国家人口健康科学数据中心(NCMI 数据库) https://www.ncmi.cn/ 关于国家人口健康科学数据中心,是集成涉及基础医学、临床医学、药学、公共卫生、中医药学、人口与生殖健康等多方面的科学数据资源。
国内资源 公共卫生科学数据中心 https://www.phsciencedata.cn/Share/index.jsp 关于中国公共卫生科学数据中心,集成了分布在公共卫生领域、高等院校、科研院所以及科学家个人手中的公共卫生数据资源以及科研项目所产生的数据。
国内资源 中国健康与养老追踪调查(CHARLS数据库) https://charls.pku.edu.cn/ 中国健康与养老追踪调查,收集了代表中国45岁及以上中老年人家庭和个人的高质量微观数据,用以分析我国人口老龄化问题。
国内资源 iProx数据库 https://www.iprox.cn/page/BWV016.html iProx是全球第二大的蛋白质组原始数据资源,由中国蛋白质组学研究者建立,旨在存储和分享基于质谱的蛋白质组学数据,促进全球蛋白质组学数据的整合和分析。
国外资源 NHANES 数据库 https://www.cdc.gov/nchs/nhanes/ 关于NHANES数据库,是美国人群营养横断面调查的数据库,包含了用于评估美国成人及儿童健康与营养状况的调查研究。
国外资源 MIMIC 数据库 https://mimic.mit.edu/ 关于MIMIC数据库,是由麻省理工学院计算生理学实验室发布的重症监护数据集,包含有将近数万条ICU住院记录。
国外资源 CHNS 数据库 https://www.cpc.unc.edu/projects/china 关于CHNS数据库,是社会健康调查的数据库,数据内容包括健康调查、营养和体质测验、食品市场调查、计划生育调查等。
国外资源 SEER 数据库 https://seer.cancer.gov/ 关于SEER数据库是一个肿瘤相关的数据库,包括人口统计数据、患者个人信息、原发灶位置、肿瘤大小、肿瘤编码、治疗方案、死亡原因等信息。
国外资源 Dryad 数据库 https://datadryad.org/stash 关于Dryad数据库是储存了医学、生物学、生态学等领域的研究数据库。
国外资源 BioLINCC 数据库 https://biolincc.nhlbi.nih.gov/home/ BioLINCC数据库是生物标本和数据采集信息中心,包含了NHBLI生物标本数据和NHBLI临床研究数据
国外资源 GHDx 数据库 http://ghdx.healthdata.org/ 关于GHDx数据库是全球健康数据中心,其数据内容包括人口普查数据、调查、注册、指标和评估,收集行政健康数据以及与健康相关的财务数据。
国外资源 GEO 数据库 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/ 关于GEO数据库是公共功能基因组学数据的存储库,接受基于阵列和序列的数据,可查询和下载实验和整理的基因表达谱。
国外资源 EMBL-EBI 数据库 https://www.ebi.ac.uk/ 关于EMBL-EBI数据库是欧洲生物信息研究所的数据库,拥有非常全面的免费分子数据资源。
国外资源 TCGA 数据库 https://www.cancer.gov/about-nci/organization/ccg/research/structural-genomics/tcga 关于TCGA数据库,它包含了33种癌症的数据,涉及关键基因组变化的全面、多维的图谱,目前已对超过1.1万多名患者的肿瘤组织及配对正常组织进行描述。
国外资源 METABRIC 数据库 https://ega-archive.org/dacs/EGAC00001000484 关于METABRIC数据库,旨在根据有助于确定最佳治疗过程的分子特征将乳腺肿瘤分类为更多的亚类。
国外资源 WHO Mortality Database 数据库 https://www.who.int/data/data-collection-tools/who-mortality-database 关于WHO Mortality Database数据库,将各个成员国居民疾病登记系统的死亡数据进行汇编并形成数据资料
国外资源 Orphanet 数据库 http://www.orpha.net/consor/cgi-bin/index.php Orphanet数据库提供罕见病和罕见病药物信息,目的在于提高罕见病的诊断、护理和治疗效果。
国外资源 PRIDE数据库 https://www.ebi.ac.uk/pride/ PRIDE是全球最大的蛋白质组原始数据资源,专门收集和存储质谱数据,特别是蛋白质和肽段的鉴定和定量信息,帮助科研人员进行蛋白质组学研究。
国外资源 MassIVE数据库 https://massive.ucsd.edu/ProteoSAFe/static/massive.jsp MassIVE是一个用于存储质谱原始数据的数据库,是最大的图谱库资源,旨在促进免费交换全球质谱数据,支持数据的在线重分析。
国外资源 PeptideAtlas数据库 https://peptideatlas.org/ PeptideAtlas是最大的肽段定量资源库,可以帮助研究者规划有针对性的蛋白质组学实验、改进基因组注释并支持数据挖掘项目。
国外资源 HPA数据库 https://www.proteinatlas.org HPA免费提供人类编码蛋白信息,是最大的抗体资源库,旨在利用多种组学技术绘制细胞、组织和器官中所有人类蛋白质的图谱
国外资源 PROTEOMICSDB数据库 https://www.proteomicsdb.org/ ProteomicsDB是一个综合性的蛋白质组学数据库,涵盖多种生物样本和疾病状态,提供高质量的蛋白质定量数据和分析工具。
国内资源 西湖(中国)生物样本库 https://wbbc.westlake.edu.cn/ 西湖生物银行项目旨在构建中国人群的生物样本库。通过收集和分析大量生物数据,推动精准医学研究与发展,项目依托西湖大学及相关服务器资源,位于浙江杭州。
国外资源 英国生物银行样本库 https://www.ukbiobank.ac.uk/ 成立于2006年,是英国迄今以来规模最大的有关致病或预防疾病的基因和环境因子的信息资源库。这个数据库的特别之处在于,它不仅收集了来自50万名志愿者的详细健康数据,还将这些数据与各种健康结果关联起来,便于科学家们进行研究。
国外资源 泛欧洲生物样本库与生物分子资源研究中心-欧洲研究中心联盟 https://www.bbmri-eric.eu/bbmri-sample-and-data-portal/ 共享了欧盟24个国家、超过200个机构的生物样本库。该联盟最新开放的2.0版目录公布其样本库网络中涵盖了515个生物样本库的资料,样本总量超过了6千万。其中包括136个临床或疾病相关的生物样本库,以及189个正常人群样本库